安徽醫(yī)科大學(xué)研究生學(xué)院是安徽醫(yī)科大學(xué)研究生教育的主管部門，設(shè)有招生辦公室、培養(yǎng)辦公室、學(xué)位辦公室、年級(jí)辦公室、就業(yè)辦公室、總支辦公室、學(xué)院辦公室等科室。截至2006年9月，學(xué)?，F(xiàn)有藥理學(xué)、皮膚病與性病學(xué)、老年醫(yī)學(xué)、流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)學(xué)、免疫學(xué)、內(nèi)科學(xué)、神經(jīng)病學(xué)、兒少衛(wèi)生與婦幼保健學(xué)8個(gè)博士學(xué)位授權(quán)學(xué)科和64個(gè)碩士學(xué)位授權(quán)學(xué)科，設(shè)有臨床醫(yī)學(xué)、藥學(xué)、公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué)3個(gè)博士后科研流動(dòng)站，具有臨床醫(yī)學(xué)專業(yè)碩士學(xué)位和公共衛(wèi)生專業(yè)碩士學(xué)位（MPH）授予權(quán)，還有1個(gè)七年制本碩連讀專業(yè)（臨床醫(yī)學(xué)）。
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