第四軍醫(yī)大學研究生教育始于1962年，招收4屆31名研究生。1978年起恢復研究生教育，開始招收研究生，1981年，成為全國首批碩士、博士學位授予單位。2000年6月，經(jīng)教育部批準試辦研究生院，2001年6月正式建院，2004年6月順利通過評估。研究生院下設招生處、教學培養(yǎng)處和學位與學科建設處，承擔著研究生招生、就業(yè)指導、教學培養(yǎng)、學位授予、博士后管理以及學科建設、“211工程”建設等工作。
研究生院依托學校雄厚的辦學實力，為研究生的培養(yǎng)創(chuàng)造了良好的學科環(huán)境。擁有博士后流動站10個，博士學位一級授權(quán)學科11個、自主設置目錄外二級學科10個、交叉學科5個，二級授權(quán)學科65個，碩士學位授權(quán)一級學科12個，二級（三級）學科69個；擁有專業(yè)學位博士授權(quán)種類2個，專業(yè)學位碩士授權(quán)種類10個，形成了以醫(yī)學為主，涵蓋哲學、教育學、理學、工學、管理學等6個學科門類，以學術(shù)學位為主、兼顧專業(yè)學位的學位授權(quán)體系。擁有國家重點學科15個、國家重點培育學科4個，國家重點實驗室2個，“211工程”三期重點建設學科12個，軍隊“2110工程”三期重點建設學科4個，總后“530”二期重點建設學科4個，“長江學者”特聘教授設崗學科18個，全軍醫(yī)學中心（專病）研究所25個，全軍醫(yī)學重點實驗室13個，還有國家臨床藥理基地3個，國家“863”細胞工程中心1個，全軍臨床藥理基地1個。
現(xiàn)有研究生導師894人，其中博士生導師310人，碩士生導師584人。導師隊伍中有中國科學院院士1人，中國工程院院士3人，“長江學者獎勵計劃”特聘教授20人， “973項目”首席科學家7人，杰出青年基金獲得者14人，國務院學位委員會學科評議組成員4人，有21人次在國際學術(shù)組織中擔任理事以上職務。
截至2014年8月，已為國家和軍隊培養(yǎng)研究生13000余人，其中博士研究生3500余人。目前，在校研究生2085人，其中博士621人。獲得全國優(yōu)秀博士學位論文11篇、提名論文11篇；全軍優(yōu)秀博士學位論文34篇、優(yōu)秀碩士學位論文40篇；陜西省優(yōu)秀博士學位論文78篇。畢業(yè)生中多數(shù)成為了軍內(nèi)外醫(yī)療衛(wèi)生領(lǐng)域的骨干和學科帶頭人。
建立了比較規(guī)范的研究生培養(yǎng)體系，形成了研究生培養(yǎng)與科學研究緊密結(jié)合、學術(shù)學位與專業(yè)學位研究生分軌培養(yǎng)的培養(yǎng)機制，完善了入學選拔、課程學習、課題研究、實踐活動、畢業(yè)答辯和和學位授予等系列完備的質(zhì)量保證體系。近年來，積極開展研究生教育創(chuàng)新活動，大力開展地方生推薦免試攻讀碩士學位、碩博連讀、直接攻博、博士課題資助、公派研究生出國項目、研究生獎助學金等，人才培養(yǎng)質(zhì)量得到進一步提升。
在新的歷史時期，研究生院將以科學發(fā)展觀為指導，深入實施“精品建校、陽光治校”方略，緊緊圍繞培養(yǎng)符合國家、軍隊需求的高層次醫(yī)學人才的目標，以“質(zhì)量”為核心，深化改革，創(chuàng)新機制，不斷推進學校研究生教育科學發(fā)展。
第四軍醫(yī)大學研究生院：//graduate.fmmu.edu.cn/