預防獸醫(yī)學，為國家重點學科、博士學位和碩士學位授予點，由我國現代獸醫(yī)教育的奠基人之一羅清生教授創(chuàng)建。國際動物衛(wèi)生組織豬鏈球菌病參考實驗室、農業(yè)部動物細菌學重點實驗室、江蘇省動物免疫工程實驗室掛靠在本學科。本學科由獸醫(yī)微生物學與免疫學、家畜傳染病學和動物寄生蟲學三個學科組組成。長期以來，本學科立足學科發(fā)展前沿和我國畜牧獸醫(yī)事業(yè)發(fā)展的現實需求，凝練學科方向，拓展研究內容，形成了分子病毒與免疫學、病原與宿主相互作用、動物傳染病發(fā)病機制和免疫、獸醫(yī)微生物致病機理及免疫、獸醫(yī)寄生蟲分子免疫學、獸醫(yī)公共衛(wèi)生等六個特色鮮明的研究生培養(yǎng)方向。圍繞這些方向，在畜禽傳染病的病毒、細菌、感染性免疫等領域取得了系列基礎研究成果。成功研制出豬鏈球菌疫苗、豬繁殖與呼吸綜合癥弱毒疫苗、豬圓環(huán)病毒滅活疫苗等防控產品，為動物疫病防控、獸醫(yī)臨床診療和畜禽健康生產做出了貢獻。
現有固定教職工44人，其中教授19名，副教授和高級實驗師12名、講師和實驗師8名。全國農業(yè)科研杰出人才和創(chuàng)新團隊2個，江蘇省特聘教授1名，江蘇省“333”工程學術人才（第二層次）1名，國家基金優(yōu)青項目1名，教育部新世紀優(yōu)秀學術人才4名，南京農業(yè)大學鐘山學術新秀3名。承擔《獸醫(yī)微生物學》、《獸醫(yī)免疫學》、《獸醫(yī)傳染病學》、《獸醫(yī)寄生蟲病學》、《獸醫(yī)生物制品學》、《動物性食品衛(wèi)生學》、《獸醫(yī)流行病學》、《畜牧微生物學》、《水產微生物學》、《動物保護學》等本科生課程及《現代動物免疫學》、《基因工程原理與方法》和《現代疫苗學》等研究生課程，設有1個預防獸醫(yī)學本科生教學實驗中心，15個本科生實習基地?，F有豬鏈球菌病OIE參考實驗室，農業(yè)部動物細菌學重點實驗室（原名：動物疫病診斷與免疫重點開放實驗室），3個校級研究室（動物疫苗創(chuàng)制中心、魚病漁藥研究室、獸醫(yī)寄生蟲病研究室）。近五年承擔國家和部省級課題80多項，科研經費累計8500余萬元，發(fā)表研究論文530余篇，其中SCI論文250余篇，獲發(fā)明專利8項，國家新獸藥注冊證書1個，獲部省級科技成果獎4項。2005年“豬鏈球菌病防控技術”獲國家科技進步二等獎。與德國、美國和加拿大等國際合作交流合作密切。主編《獸醫(yī)傳染病學》（第六版）、《獸醫(yī)微生物學》（第五版）、《動物保護學概論》和《獸醫(yī)生物制品學》（第三版）等全國統編教材4部，出版專著10部。