船舶與機電工程學院是學校最具海洋工程特色和優(yōu)勢的學院，也是學校最早承擔工科研究生教育的單位之一。學院前身為1978年浙江水產(chǎn)學院的漁業(yè)機械系，經(jīng)過40年的勵精圖治、發(fā)展壯大，目前已擁有8個本科專業(yè)，1個中外合作辦學項目（船舶與海洋工程專業(yè)與俄羅斯合作辦學）；2個一級學科碩士學位點，1個農(nóng)業(yè)碩士專業(yè)學位領(lǐng)域，2個省一流學科，1個省重點實驗室；建有1個國家級特色專業(yè)、4個省重點優(yōu)勢特色專業(yè)，1個國家級實驗教學示范中心、3個省級實驗教學示范中心；為農(nóng)林學科與研究生教育學會水產(chǎn)漁業(yè)學科協(xié)作組主任委員單位，浙江海洋大學舟山制造業(yè)項目專家評估研究中心掛靠學院。學院下設(shè)4個系，3個研究所、1個教研室，1個實驗實踐教學管理中心、下設(shè)7個專業(yè)實驗室；現(xiàn)有全日制大學本科生1582人、碩士研究生152人；在職教職工90人，其中教授20人、副教授27人，博士27人，省錢江學者1人、省“千人”1人、省“萬人計劃”1人，省中青年學科帶頭人6人、省“151”工程培養(yǎng)人選5人、省優(yōu)秀教師4人、省教學名師2人、省教壇新秀1人、舟山市專業(yè)技術(shù)拔尖人才2人、舟山市“111人才工程”人員14人。
至2020年，學院辦學水平得到較大幅度提升。船舶與海洋工程學科成為博士學位授權(quán)點，機電類本科專業(yè)力爭工程教育認證，船舶與海洋工程學科成為浙江省船舶工程學會理事長單位，成為浙江省船舶與海洋工程領(lǐng)域重要的智囊團和技術(shù)支撐單位，學科綜合排名力爭位居國內(nèi)同類高校前20%；機電類學科能夠較好的支撐與服務(wù)舟山群島新區(qū)、舟山自由貿(mào)易試驗區(qū)和舟山江海聯(lián)運服務(wù)中心建設(shè)，機電類本科成為辦學特色鮮明的學校示范專業(yè)；學院成為我國重要的涉海工科人才培養(yǎng)基地和科技研發(fā)平臺。