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據(jù)2014年2月學(xué)校官網(wǎng)顯示，學(xué)校設(shè)有臨床醫(yī)學(xué)、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、藥學(xué)3個一級學(xué)科碩士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)，涵蓋3個一級學(xué)科所屬二級學(xué)科46個專業(yè)，本科層次開設(shè)有醫(yī)學(xué)、理學(xué)和管理學(xué)3個學(xué)科門類、27個專業(yè)（含方向），?？茖哟尉邆湔猩Y格的專業(yè)有21個；國家臨床重點(diǎn)?？平ㄔO(shè)項(xiàng)目1個（急診醫(yī)學(xué)）、國家中醫(yī)藥管理局中醫(yī)藥重點(diǎn)學(xué)科1個（中醫(yī)肝膽病學(xué)）。擁有省級重點(diǎn)學(xué)科（含醫(yī)學(xué)重點(diǎn)學(xué)科）8個（內(nèi)科學(xué)、藥物化學(xué)、婦產(chǎn)科學(xué)、神經(jīng)內(nèi)科學(xué)、醫(yī)學(xué)影像學(xué)、病理學(xué)等）。
教學(xué)建設(shè)
教學(xué)成果
據(jù)2014年2月學(xué)校官網(wǎng)顯示，學(xué)校擁有國家特色專業(yè)建設(shè)點(diǎn)2個（藥學(xué)專業(yè)、臨床醫(yī)學(xué)專業(yè)），國家級教育培訓(xùn)基地1個（衛(wèi)生部全科醫(yī)學(xué)?？漆t(yī)師培訓(xùn)（海南）試點(diǎn)基地）、全國科普教育基地1個（海南省人類生命科技館）、國家級實(shí)驗(yàn)教學(xué)示范中心建設(shè)單位1個（臨床技能實(shí)驗(yàn)教學(xué)中心）、國家精品視頻公開課建設(shè)選題1項(xiàng)（《病理學(xué)》課程“腫瘤知識ABC”）。
建有省級教學(xué)示范中心3個（臨床技能實(shí)驗(yàn)教學(xué)中心、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)教學(xué)中心、教育技術(shù)中心）、省級特色專業(yè)8個（臨床醫(yī)學(xué)、藥學(xué)、預(yù)防醫(yī)學(xué)、中醫(yī)學(xué)、醫(yī)學(xué)影像學(xué)、護(hù)理學(xué)、醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)、口腔醫(yī)學(xué)）、省級教學(xué)團(tuán)隊(duì)4個（實(shí)驗(yàn)生理科學(xué)、醫(yī)學(xué)影像學(xué)、藥學(xué)、病理學(xué)）、省級重點(diǎn)課程3門（生物化學(xué)與分子生物學(xué)、生理學(xué)、病理學(xué)與病理生理學(xué)）及17門省級精品課程（醫(yī)學(xué)免疫學(xué)、病理學(xué)、診斷學(xué)、生理學(xué)、生物化學(xué)、臨床生物化學(xué)與生物化學(xué)檢驗(yàn)、系統(tǒng)解剖學(xué)、流行病學(xué)、組織學(xué)與胚胎學(xué)、醫(yī)學(xué)微生物學(xué)、病理生理學(xué)、人體寄生蟲學(xué)、普通心理學(xué)、天然藥物化學(xué)、醫(yī)學(xué)影像學(xué)、臨床血液學(xué)與檢驗(yàn)等）。 
從1996年開始，學(xué)校陸續(xù)出臺了課程建設(shè)標(biāo)準(zhǔn)和管理辦法。據(jù)2014年2月學(xué)校官網(wǎng)顯示，學(xué)校共開設(shè)了749門課程，其中，本科課程449門，?？萍俺扇私逃n程300門；各專業(yè)課程全部通過了合格課程評估；校級重點(diǎn)課程5門，校級精品課程10門，在建網(wǎng)絡(luò)課程208門，優(yōu)秀網(wǎng)絡(luò)課程15門。獲得教育教學(xué)研究課題109項(xiàng)，學(xué)校教育教學(xué)研究課題72項(xiàng)，學(xué)校CAI課件立項(xiàng)30項(xiàng)，省級教學(xué)成果6項(xiàng)，全國多媒體教育軟件4項(xiàng)，省級多媒體教材（軟件）獎18項(xiàng)。
此外，海南醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院是全國綜合醫(yī)院中醫(yī)藥工作示范單位、海南省首家國家醫(yī)師資格考試實(shí)踐技能考試基地與考官培訓(xùn)基地、海南省唯一的國際旅行者醫(yī)療救助協(xié)會（IAMAT）成員單位、國家衛(wèi)生部人類輔助生殖技術(shù)技術(shù)準(zhǔn)入機(jī)構(gòu)、國家人力資源和社會保障部批準(zhǔn)的目前全省惟一的博士后科研工作站的醫(yī)療機(jī)構(gòu)。