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截至2015年1月，該校共有省部級重點學科25個，一級學科博士后科研流動站1個，一級學科博士學位授權點3個，二級學科博士學位授權點11個，一級學科碩士學位授權點12個，二級學科碩士學位授權點56個。有農(nóng)業(yè)推廣碩士、獸醫(yī)碩士、工程碩士、翻譯碩士、體育碩士、風景園林碩士6個專業(yè)學位類別，其中，農(nóng)業(yè)推廣碩士13個領域，工程碩士、體育碩士均為3個領域 。
省部級重點學科：農(nóng)業(yè)資源利用、農(nóng)業(yè)水土工程、畜牧學、植物病理學、作物遺傳育種、動物食品科學、農(nóng)業(yè)經(jīng)濟管理、農(nóng)業(yè)昆蟲與害蟲防治、環(huán)境科學與工程、農(nóng)業(yè)資源利用、植物營養(yǎng)學、園藝等
博士后科研流動站：植物保護
一級學科博士學位授權點：作物遺傳育種、植物保護、畜牧學
一級學科碩士學位授權點：作物遺傳育種、植物保護、環(huán)境科學與工程、科學技術史、作物學、農(nóng)業(yè)資源利用、畜牧學、食品科學與工程、農(nóng)業(yè)工程
教學建設
截至2015年1月，該校共有66個本科專業(yè)，其中國家級特色專業(yè)6個、省級特色專業(yè)7個、省級重點建設專業(yè)8個。有在職人員申請碩士學位審批權和外國留學生招生權。先后擁有了國家級教學名師、國家級精品課程、國家級實驗教學示范中心、國家級人才培養(yǎng)模式創(chuàng)新實驗區(qū)、國家級特色專業(yè)建設點。云南省生物多樣性和生物技術創(chuàng)新人才培養(yǎng)基地、云南省環(huán)境科學與工程創(chuàng)新人才培養(yǎng)基地各1個；學校還建有校內(nèi)實驗農(nóng)場和實習工廠及60多個校外實踐教學基地。
學校先后兩次修訂本科專業(yè)人才培養(yǎng)方案，2008年，以“加強基礎、通專結(jié)合、強化實踐”為重點，構建復合型、應用型人才培養(yǎng)模式，2010年，強調(diào)通專結(jié)合、分類培養(yǎng)，強化專業(yè)和實踐教學，構建多樣化的人才培養(yǎng)模式和體系；形成國家、省、學校三個層面的三級“質(zhì)量工程”體系，共獲準立項質(zhì)量工程項目國家級45項、省級172項、校級81項；建設了課程開發(fā)系統(tǒng)、自主學習中心、實驗教學中心、教學科研基地以及教學管理五大教學平臺。
2001年至2015年1月，共立項資助教改項目近140項；先后獲國家級教學成果二等獎2項、優(yōu)秀獎1項，省級教學成果特等獎1項、一等獎9項、二等獎26項；2005-2013年，連續(xù)9年評為云南省高校畢業(yè)生就業(yè)考評優(yōu)秀，入選2011-2012年度全國畢業(yè)生就業(yè)50所典型經(jīng)驗高校，被國務院授予“全國就業(yè)先進工作單位”榮譽稱號 。
國家級特色專業(yè)：生物技術、農(nóng)學、園藝、茶學、動物科學、植物保護
國家級人才培養(yǎng)模式創(chuàng)新實驗區(qū)：邊疆民族地區(qū)農(nóng)業(yè)工程創(chuàng)業(yè)人才培養(yǎng)模式創(chuàng)新實驗區(qū)
國家級卓越工程師教育培養(yǎng)計劃建設專業(yè)：水利水電工程、農(nóng)業(yè)機械化及其自動化
國家級精品課程：普通植物病理學、煙草栽培學
省級特色專業(yè)：農(nóng)學、食品質(zhì)量與安全、蜂學、水利水電工程、農(nóng)業(yè)機械化及其自動化等
省級重點建設專業(yè)：生物技術、植物保護、水利水電工程、動物科學、農(nóng)業(yè)資源與環(huán)境等
云南省卓越工程師教育培養(yǎng)計劃建設專業(yè)：水利水電工程、農(nóng)業(yè)機械化及其自動化、機械設計制造及其自動化、土木工程
省級精品課程：普通植物病理學、大學計算機基礎、作物栽培學、煙草栽培學、普通昆蟲學、普洱茶文化學、動物飼養(yǎng)學、鮮切花栽培學、動物育種學、農(nóng)藥學、土壤肥料學、牧草與草坪草種子學、土壤、植株與環(huán)境分析 （雙語）、肉品工藝學、Visual Basic程序設計、植物學、動物病理學、園藝植物栽培學、農(nóng)業(yè)機械學、動物生物化學、植物生理學、環(huán)境生態(tài)學
云南省高等學校實驗教學示范中心：作物學實驗教學中心、農(nóng)業(yè)工程專業(yè)基礎實驗教學示范中心、煙草科學與工程實驗教學中心、動物醫(yī)學實驗教學中心、植物保護學實驗教學中心